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中国科学院生物与化学交叉研究中心将以神经退行性疾病和肿瘤为主要研究对象，集中各学科的优势开展深入的研究。以期在神经生物学、细胞生物学和化学生物学领域的基础研究方面做出国际领先的成果，同时为神经退行性疾病的诊断和肿瘤的治疗提供新的技术，为神经退行性疾病和肿瘤的新药研究提供创新结构的新药先导化合物和筛选靶点，促进我国创新药物领域的发展。并达到以下目标：
1．建设世界一流水平的生物与化学交叉研究中心：包括一支世界一流的从事神经生物学、细胞生物学、化学生物学和药物化学研究的人才队伍。
2．系统地研究非细胞凋亡的细胞死亡的机理和相关的生理作用，了解化学干扰造成神经退行性疾病的生物信号网络，发展化学手段调控炎症分子机理的新方法，发展研究神经退行性疾病治疗药物的新模式。每年在Cell, Nature, Science, PNAS 等杂志上发表10-30篇高水平的科学论文。
3．发现干扰神经退行性疾病及肿瘤的小分子化合物，与制药公司合作开发具有自主知识产权的创新药物；